2010年，超大型台风横扫福冈冲，这片海域上名为“列格利亚”的天然气钻井平台遭到猛烈袭击，其附近一艘货船撞向平台，引发强烈火灾。为了防止造成惨烈的损失，保护国家的重大课题项目，隶属第十管区鹿儿岛航空基地的仙崎大辅（伊藤英明 饰）和伙伴吉冈哲也（佐藤隆太 饰）等海猿战士临危受命，在平台所属公司的设计者樱木浩一郎（加藤雅也 饰）的引领下进入危机四伏的“列格利亚”。台风没有丝毫减弱的迹象，而“列格利亚”随时可能发生超强大爆炸。生死关头，仙崎和战友面临前所未有的大考验……海猿3：最后的讯息